More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1917 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  100 
 
 		 287 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  98.26 
 
 		 287 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  88.73 
 
 		 286 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  88.69 
 
 		 294 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  88.69 
 
 		 294 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  88.34 
 
 		 294 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  82.73 
 
 		 285 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  71.38 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  71.7 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  67.14 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  70.29 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  65.96 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  65.96 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  68.38 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  69.45 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  65.96 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  67.78 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  65.96 
 
 		 286 aa  377  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  69 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  65.25 
 
 		 286 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  65.25 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  65.25 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  65.25 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  65.25 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  66.54 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  60.5 
 
 		 285 aa  335  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  62.92 
 
 		 286 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  62.92 
 
 		 286 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  63.67 
 
 		 286 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  50.18 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  46.83 
 
 		 291 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  47.04 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  48.16 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  47.14 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  47.12 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  47.14 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  46.38 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  46.69 
 
 		 285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  46.13 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  46.13 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  46.52 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  45.16 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  41.67 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  42.55 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  43.77 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  44.27 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  45.79 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.79 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  44.61 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  44.91 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  40.45 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  42.08 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  42.08 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  45.56 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  42.08 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.75 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  43.28 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  44.09 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.37 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.37 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.37 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  39.39 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  40 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.37 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  45.42 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  45.59 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  43.07 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  38.04 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  42.21 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  42.21 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  40.53 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  40.53 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  38.99 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  41.51 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  38.87 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  40 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.77 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  40 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  42.19 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  37.68 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  39.71 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  38.13 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  38.13 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  33.94 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  37.1 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  38.85 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.96 
 
 		 280 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  37.26 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  37.02 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  36.9 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  38.57 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.25 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.53 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.53 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  35.79 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.07 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>