More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0440 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  100 
 
 		 281 aa  541  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  56.65 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  44.4 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  38.87 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  38.67 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  39.38 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  38.55 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.31 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.41 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  34.56 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  30 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.53 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  35.32 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  32.42 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  34.51 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  30.35 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.37 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.55 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  26.22 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 371 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  28.06 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.57 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  27.54 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  27.38 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  26.97 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  26.97 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  26.97 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  26.97 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  26.97 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.97 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  30.45 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  27.7 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  32.37 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  28.06 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 312 aa  95.5  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.16 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  24.73 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  24.73 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 		 270 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  28.46 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 264 aa  92.4  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  25.48 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  25.48 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.57 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  26.52 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.55 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  27.51 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  31.15 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  27.57 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  26.85 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  27.04 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  26.8 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  26.55 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  28.14 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  27 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  25.57 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  28.08 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.45 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  27.14 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.2 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  25.88 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>