More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1701 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  100 
 
 		 266 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  86.04 
 
 		 265 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  71.54 
 
 		 270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  72.54 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  72.54 
 
 		 260 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  71.31 
 
 		 260 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  72.36 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  61.11 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  51.98 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  51.14 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  52.07 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  51.65 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  51.65 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  50.79 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  51.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  52.48 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  49.21 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  48.02 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  53.57 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  51.19 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  49.44 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  52.17 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  51.33 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  52.89 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  50.83 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  50.83 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  51.9 
 
 		 263 aa  214  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  46.18 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  50.98 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  50.98 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  50.98 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  43.8 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  52.89 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  48.21 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  50.42 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  53.01 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  53.69 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  48.83 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  46.59 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  54.55 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  54.55 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  46.58 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  51.44 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  52.21 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  48.13 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  44.62 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  51.41 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  53.68 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  53.25 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  53.68 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  52.21 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  46.59 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.14 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  32.66 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.99 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  34.14 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  36.51 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.74 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.74 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  35.86 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.32 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.2 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  36.82 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  36.18 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.47 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  35.06 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.61 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.66 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  36.78 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.21 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  36.65 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.94 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  35.8 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.62 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.8 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  34.43 
 
 		 289 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  35.39 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>