More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2338 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  95.67 
 
 
277 aa  449  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0182  ABC-3 protein  73.58 
 
 
264 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0759014  decreased coverage  0.00115812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  35.43 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  41.13 
 
 
272 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  39.93 
 
 
273 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  39.29 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  36.14 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  35.74 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  40.65 
 
 
273 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.4 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  34.39 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  33.99 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  33.99 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  33.99 
 
 
261 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  38 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  33.99 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  33.6 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  34 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  33.6 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  38.24 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  36.55 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  38.39 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  34.78 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  130  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  36.29 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.43 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  34.94 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  36.25 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  34 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  36.43 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  36.63 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  37.04 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  35.65 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  34 
 
 
268 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  35.71 
 
 
261 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  36.9 
 
 
261 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  36.9 
 
 
261 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  36.9 
 
 
261 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.07 
 
 
266 aa  125  7e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  33.33 
 
 
261 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  34.58 
 
 
262 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  36.44 
 
 
260 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  36.44 
 
 
260 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  38.14 
 
 
262 aa  122  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  31.62 
 
 
261 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  37 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  38.98 
 
 
266 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  34.2 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  37.95 
 
 
275 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  34.14 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  32.11 
 
 
261 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  35.42 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  31.66 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  35 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  35 
 
 
260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  35.42 
 
 
260 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.57 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
262 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  28.57 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  29.89 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.54 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.54 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.54 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.54 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.54 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.55 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.36 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.15 
 
 
278 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.15 
 
 
278 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.68 
 
 
278 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.31 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.85 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  27.13 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  28.85 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.46 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.58 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.46 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.05 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.63 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.48 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  30 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  31.75 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  30.21 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  27.53 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>