More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1149 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  100 
 
 		 273 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  65.25 
 
 		 239 aa  308  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2858  ABC-3 protein  55.56 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.997835 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  40.46 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  37.64 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2084  hypothetical protein  34.22 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0776  ABC-3 protein  38.19 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  36.06 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  35.08 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  35.08 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  39.46 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1098  hypothetical protein  35.29 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.46 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.82 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.38 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.69 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.69 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0294  hypothetical protein  35.41 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.400849  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.98 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  31.76 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.8 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  31.98 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.84 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.84 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  34.78 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 275 aa  125  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  33.21 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  35.57 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.94 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  30.53 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  35.94 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  33.58 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.96 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.46 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.71 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.62 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.93 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  27.93 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.48 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.65 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  29.48 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  34.87 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  29.12 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  35.32 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.42 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.56 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.57 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.57 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 285 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  33.99 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.66 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  30.38 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  30.61 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  32.44 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  30.12 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  30.37 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  33.46 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.19 
 
 		 286 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>