More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1098 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1098  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  553  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2084  hypothetical protein  61.23 
 
 
276 aa  345  5e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0294  hypothetical protein  58.55 
 
 
276 aa  308  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.400849  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0776  ABC-3 protein  33.21 
 
 
271 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  35.29 
 
 
273 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  30.96 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2858  ABC-3 protein  32.79 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.997835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.68 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  32.17 
 
 
277 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  31.13 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  31.13 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.71 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  31.17 
 
 
269 aa  106  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
274 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.24 
 
 
285 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.91 
 
 
266 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.45 
 
 
272 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.59 
 
 
279 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  28.57 
 
 
268 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  29.67 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  28.39 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  27.76 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  27.34 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  28.75 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  30.55 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.29 
 
 
277 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  31.49 
 
 
273 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  26.29 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  27.13 
 
 
281 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  28.84 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  25.58 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.28 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  25.59 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.76 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.28 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  26.62 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  25.67 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  26.67 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  25.38 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.7 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.7 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  27.41 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  25.3 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  31.91 
 
 
273 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  25.67 
 
 
264 aa  87  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  28.46 
 
 
267 aa  85.9  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  23.89 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  27.27 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  23.42 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  24.49 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  23.42 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  29.1 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  25.86 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  23.42 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  27.71 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  31.91 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  30.77 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  25.77 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  24.62 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  32.5 
 
 
269 aa  82  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  29.58 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  24.23 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  29.96 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  26.88 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  28.83 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  27.56 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  28.74 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  25.48 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  26.75 
 
 
271 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  29.77 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  23.35 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  30.49 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  24.58 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  26.95 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  28.03 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  25.7 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  26.3 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  23.29 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  26.98 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  23.29 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  24.91 
 
 
261 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  25.37 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  26.47 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.55 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  26.25 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  25.61 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  25.2 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  23.81 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  25.58 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  25.58 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  25.58 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>