More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2086 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  52.19 
 
 
266 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  55.22 
 
 
269 aa  240  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  46.72 
 
 
272 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  52.65 
 
 
272 aa  216  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  46.33 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  48.01 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  49.42 
 
 
273 aa  209  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  42.64 
 
 
277 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  51.36 
 
 
273 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  52.31 
 
 
273 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  49.1 
 
 
281 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  45.35 
 
 
275 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  52.96 
 
 
275 aa  202  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  43.02 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  51.15 
 
 
269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  44.32 
 
 
274 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  40.22 
 
 
275 aa  198  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  42.42 
 
 
276 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  38.97 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  42.69 
 
 
273 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  41.27 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  40.87 
 
 
268 aa  188  9e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  39.92 
 
 
269 aa  186  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  52.51 
 
 
273 aa  186  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 
267 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  47.89 
 
 
269 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  39.86 
 
 
279 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  49.42 
 
 
281 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
273 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  38.6 
 
 
274 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  43.08 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  44.13 
 
 
264 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  37.55 
 
 
267 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  35.02 
 
 
279 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.11 
 
 
285 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  35.19 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  37.35 
 
 
268 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.85 
 
 
274 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.73 
 
 
274 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  35.94 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  35.94 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.39 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.77 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.36 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  35.58 
 
 
267 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.68 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.7 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.24 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.42 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.33 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.12 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  30.04 
 
 
276 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.2 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.88 
 
 
277 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.05 
 
 
301 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.8 
 
 
287 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.27 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  30.43 
 
 
281 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1683  ABC-3 protein  37.02 
 
 
265 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  33.46 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.92 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.13 
 
 
280 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.92 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.57 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.5 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.37 
 
 
264 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  29.28 
 
 
291 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.5 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  31.87 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  32.82 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30.92 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  28.87 
 
 
285 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
288 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  30.28 
 
 
267 aa  112  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.75 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.75 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  28.3 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  36.25 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.25 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.05 
 
 
290 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.96 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  27.92 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31.97 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.5 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  29.25 
 
 
261 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>