More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0698 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  41.5 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 
274 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  34.69 
 
 
272 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  34.32 
 
 
272 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  37.85 
 
 
266 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  34.33 
 
 
277 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  38.67 
 
 
281 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  35.46 
 
 
275 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
267 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  32.52 
 
 
273 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
267 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  38.49 
 
 
273 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
267 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  32.33 
 
 
268 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  32.54 
 
 
276 aa  139  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  38.37 
 
 
273 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
275 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  36.8 
 
 
275 aa  136  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  37.2 
 
 
272 aa  136  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  32.77 
 
 
274 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  33.7 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  31.09 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  36.82 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  36.82 
 
 
269 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  32.64 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  37.39 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  32.64 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  29.01 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.67 
 
 
272 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  37.55 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  28.31 
 
 
275 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.49 
 
 
277 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  27.46 
 
 
272 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  31.76 
 
 
268 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  31.82 
 
 
268 aa  102  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  29.18 
 
 
272 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  25.83 
 
 
289 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  28.27 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  28.27 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.33 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.12 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  25.22 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 
272 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30.34 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30.34 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30.34 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30.34 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.91 
 
 
277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  30.34 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  25.39 
 
 
277 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  28.31 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
277 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  28.74 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  27.13 
 
 
276 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  29.43 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  26.09 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  30.99 
 
 
264 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.4 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.09 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3807  ABC-3 protein  32.93 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  29.75 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  26.24 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  25.09 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  25.62 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.25 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.25 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.25 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  26.69 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  28.29 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.81 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  24.14 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  26.59 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.57 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.34 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.39 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  25.94 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  26.77 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  26.96 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  23.95 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  26.61 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  23.95 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  23.95 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.3 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  23.95 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  23.95 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  26.35 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  23.95 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  23.57 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  23.57 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>