More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1993 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  100 
 
 		 471 aa  935    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  30.41 
 
 		 415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  36.45 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  37.67 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 370 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  28.87 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  28.28 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  36.42 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  30.13 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 307 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  35.23 
 
 		 293 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  36.4 
 
 		 295 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  38.04 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  35.84 
 
 		 297 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  36.63 
 
 		 377 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  35.82 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.8 
 
 		 280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  37.84 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  30.36 
 
 		 421 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.62 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  34.34 
 
 		 287 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  31.13 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 312 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 312 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 278 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 278 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.43 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.09 
 
 		 281 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 285 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.86 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.34 
 
 		 290 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  33.45 
 
 		 289 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  31.9 
 
 		 290 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.6 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 280 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.79 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  32.67 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  32.67 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 277 aa  108  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 312 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  27.93 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.61 
 
 		 304 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.77 
 
 		 278 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.77 
 
 		 278 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.37 
 
 		 291 aa  104  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  27.7 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  33.69 
 
 		 287 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.68 
 
 		 285 aa  104  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 284 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.54 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.15 
 
 		 297 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.71 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  30.58 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.15 
 
 		 297 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.71 
 
 		 288 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.15 
 
 		 297 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 287 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.74 
 
 		 264 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.64 
 
 		 285 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 284 aa  100  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 287 aa  100  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 286 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  31.84 
 
 		 285 aa  100  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  26.81 
 
 		 292 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 289 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.18 
 
 		 285 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.12 
 
 		 285 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  31.46 
 
 		 289 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  34.72 
 
 		 277 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.65 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.11 
 
 		 287 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 284 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 277 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.07 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  27.24 
 
 		 294 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 294 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 		 277 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  29.88 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  27.86 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 306 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 281 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  32.67 
 
 		 290 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  94  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  31.29 
 
 		 286 aa  94.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>