More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0690 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  100 
 
 		 385 aa  743    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  72.8 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  61.77 
 
 		 306 aa  351  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  59.79 
 
 		 293 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  49.66 
 
 		 314 aa  297  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  56.49 
 
 		 295 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  57.64 
 
 		 297 aa  279  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  45.17 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  51.34 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  46.62 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  40.49 
 
 		 415 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  45.63 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  38.44 
 
 		 428 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  40.97 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  49.57 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  38.14 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  48.99 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  37.33 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.48 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  35.47 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  32.37 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  36.07 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  35.99 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  35.92 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  35.99 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  35.99 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  36.31 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  39.45 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  36.6 
 
 		 281 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  34.86 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  36.23 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 280 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 277 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.53 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.84 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.77 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  37.69 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  36.59 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.31 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  33.33 
 
 		 287 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.19 
 
 		 276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.95 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  36.14 
 
 		 287 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  26.77 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  32.07 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  34.38 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  37.16 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.71 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.71 
 
 		 290 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  33.85 
 
 		 285 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  31.39 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  32.37 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.27 
 
 		 277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  35.61 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.87 
 
 		 286 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.73 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  30.47 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.73 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  35.56 
 
 		 301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  30.07 
 
 		 286 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.43 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.43 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.43 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.39 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.43 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.43 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  31.27 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  33 
 
 		 286 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  31.43 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  31.93 
 
 		 291 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 281 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  31.27 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  29.79 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  23.98 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  33.43 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  34.04 
 
 		 299 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>