More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5660 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  56 
 
 
290 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  58.27 
 
 
291 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  53.05 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  51.96 
 
 
290 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  52.67 
 
 
290 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  53.82 
 
 
289 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  56.73 
 
 
291 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  52.92 
 
 
284 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  54.55 
 
 
291 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  54.24 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  52.75 
 
 
284 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  53.09 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  56.23 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  55.87 
 
 
295 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  56.57 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  50.18 
 
 
284 aa  252  6e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  49.3 
 
 
286 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  51.25 
 
 
290 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  52.9 
 
 
296 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  48.94 
 
 
293 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  53.26 
 
 
290 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  51.96 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  56.49 
 
 
290 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  55.68 
 
 
288 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  54.85 
 
 
288 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  52.28 
 
 
299 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  51.25 
 
 
289 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  51.31 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  55.27 
 
 
288 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  53.85 
 
 
290 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  51.28 
 
 
290 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  51.66 
 
 
288 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  53.48 
 
 
290 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  52.11 
 
 
304 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  52 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  49.65 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  45.19 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  50.74 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  51.97 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  40 
 
 
284 aa  183  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  53.45 
 
 
295 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  37.36 
 
 
304 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.98 
 
 
281 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.5 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.52 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.52 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.16 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  26.33 
 
 
277 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.62 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.08 
 
 
300 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.86 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  29.04 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.82 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.82 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  28.21 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  31.5 
 
 
415 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.82 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.82 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.74 
 
 
297 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.74 
 
 
297 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.74 
 
 
297 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.91 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  31.8 
 
 
272 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  29.75 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  31.8 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  29.75 
 
 
290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  30.99 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.85 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.67 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  33.21 
 
 
283 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.42 
 
 
276 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  31.77 
 
 
351 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.3 
 
 
286 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  34.54 
 
 
271 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  34.54 
 
 
271 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.58 
 
 
281 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  27.74 
 
 
290 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  30.86 
 
 
276 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  27.41 
 
 
290 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  28.31 
 
 
291 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.55 
 
 
296 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.03 
 
 
287 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.41 
 
 
285 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 
370 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  26.16 
 
 
368 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.43 
 
 
285 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  30.91 
 
 
286 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  31.64 
 
 
361 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  28.42 
 
 
307 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  33.73 
 
 
303 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.79 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.6 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.77 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>