More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0704 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  100 
 
 		 376 aa  746    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  46.05 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  42.3 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  41.64 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  38.55 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  47.27 
 
 		 282 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  42.06 
 
 		 366 aa  232  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  37.15 
 
 		 376 aa  228  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  44.62 
 
 		 364 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  45.04 
 
 		 293 aa  222  8e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  40.06 
 
 		 361 aa  209  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  39.86 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  38.04 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  42.63 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  38.83 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.29 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.72 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.53 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.1 
 
 		 288 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 280 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  30.58 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.67 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.67 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.98 
 
 		 277 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  33.22 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  32.35 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.61 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 278 aa  124  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.1 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.65 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  32.31 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.75 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.56 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  34.62 
 
 		 278 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.58 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  34.62 
 
 		 278 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.27 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.27 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.93 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.97 
 
 		 277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  31.63 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.82 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.24 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.02 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.97 
 
 		 282 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.97 
 
 		 282 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.97 
 
 		 282 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.97 
 
 		 282 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  30.94 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  30.58 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  30.48 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  30.71 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.98 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  28.81 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.97 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  29.86 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  31.8 
 
 		 280 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.04 
 
 		 285 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  35.15 
 
 		 279 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  29.08 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.36 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  33.18 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  26.1 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  25.81 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  28.72 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.08 
 
 		 276 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  30.12 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  31.35 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.01 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  28.15 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  24.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  28.09 
 
 		 294 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  26.43 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  25.37 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>