More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2850 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  75.24 
 
 
308 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  74.27 
 
 
308 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  40.56 
 
 
366 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
386 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  41.78 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  40.58 
 
 
458 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  36.99 
 
 
292 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  34.78 
 
 
368 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  153  4e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  32.35 
 
 
376 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  35.86 
 
 
293 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
370 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  38.81 
 
 
364 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  36.67 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  41.4 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  34.93 
 
 
367 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  39.31 
 
 
383 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  35.91 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  30.51 
 
 
365 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.51 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.43 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  34.15 
 
 
288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  34.15 
 
 
288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.94 
 
 
304 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  34.96 
 
 
295 aa  122  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 
366 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.84 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
370 aa  119  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  29.64 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34.48 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.12 
 
 
278 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  31.03 
 
 
293 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.12 
 
 
278 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.95 
 
 
286 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.98 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  36.11 
 
 
421 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  35.69 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.23 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.12 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.18 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.12 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.62 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.7 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  33.73 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  31.43 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  30.77 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.1 
 
 
276 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  34.24 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.55 
 
 
351 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  33.33 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.06 
 
 
291 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  31.01 
 
 
291 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  32.52 
 
 
285 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.14 
 
 
285 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  31.25 
 
 
280 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  29.33 
 
 
314 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  31.69 
 
 
289 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  32.52 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.35 
 
 
285 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.57 
 
 
282 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  30.74 
 
 
295 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  30.98 
 
 
306 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  32.51 
 
 
295 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.62 
 
 
285 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.14 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.14 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.14 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.14 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.56 
 
 
276 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  28.1 
 
 
307 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  30.26 
 
 
301 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.57 
 
 
277 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.75 
 
 
282 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 
277 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.92 
 
 
297 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  32.93 
 
 
274 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.92 
 
 
297 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.92 
 
 
297 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.6 
 
 
286 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  33.19 
 
 
285 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  28.92 
 
 
296 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.35 
 
 
281 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  30.07 
 
 
290 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  30.51 
 
 
289 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.13 
 
 
285 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  31.36 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  28.48 
 
 
307 aa  99  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  31.4 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  35.1 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  30.42 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  31.9 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  27.8 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  31.12 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.93 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  30.51 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  24.9 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  29.54 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>