More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0225 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  100 
 
 		 282 aa  531  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  54.81 
 
 		 365 aa  295  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  51.46 
 
 		 367 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  47.62 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  47.27 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  45.05 
 
 		 376 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  49.64 
 
 		 386 aa  237  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  43.6 
 
 		 368 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  45.16 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  41.96 
 
 		 383 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  41.84 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  40.21 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  44.64 
 
 		 364 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  43.82 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  43.01 
 
 		 371 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  35.61 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.21 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.98 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  29.5 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.58 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.95 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.54 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.54 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  29.81 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.1 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  28.3 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.08 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.41 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.41 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.41 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31.43 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.07 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  28.26 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.41 
 
 		 282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  29.8 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.7 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.7 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.04 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  27.44 
 
 		 291 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.52 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  26.97 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  28.23 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  29.5 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 280 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  28.93 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  29.64 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.25 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.05 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.11 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  29.89 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  30.14 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.12 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.26 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  32.21 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.09 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  28.29 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  27.07 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.46 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  24.91 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  29.11 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.02 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  28.12 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  28.02 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.79 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  26.97 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.02 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  27.89 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  27.92 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  28.79 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  27.04 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  27.92 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  30.4 
 
 		 290 aa  98.6  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>