More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1721 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 370 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  76.42 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  61.33 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  53.42 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  52.63 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  54.92 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  47.08 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  49.45 
 
 		 371 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  42.74 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  49.86 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  39.95 
 
 		 376 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  47.32 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  44.71 
 
 		 292 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  45.82 
 
 		 282 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  43.63 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  42.86 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  40.36 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  43.21 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.19 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.19 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  39.67 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.64 
 
 		 280 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  38.7 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.85 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.85 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  39.04 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  29.44 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.81 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  30 
 
 		 351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.94 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  30.1 
 
 		 441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  35.79 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.49 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.01 
 
 		 277 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  33.23 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  31.77 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.98 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  30.21 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.72 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  33.82 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.41 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.44 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.12 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  35.46 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.09 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.09 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.09 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  31.65 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.09 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  32.03 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.24 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  33.46 
 
 		 290 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.32 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.09 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  30.32 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.88 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  29.14 
 
 		 415 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  31.07 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.51 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.51 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.51 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.51 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  31.03 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.82 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.16 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  34.07 
 
 		 290 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 287 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.48 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  33.08 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.36 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  31.63 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  28.28 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>