More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 		 286 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  52.04 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  47.21 
 
 		 364 aa  198  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  47.25 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  36.29 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  36.3 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  42.7 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  37.88 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  37.82 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 		 386 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  37.28 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  36.47 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  35.61 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  39.48 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 		 366 aa  148  9e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 370 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  38.2 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  36.88 
 
 		 458 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  38.81 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  36.93 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.33 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  35.95 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  35.63 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.48 
 
 		 280 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.6 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.06 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.6 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.22 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.92 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  30.64 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.4 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.4 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.42 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  32.5 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  33.84 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.96 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.47 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  34.18 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.23 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  34.96 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.06 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.48 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.95 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.48 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  29.77 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  30.15 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  29.77 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.78 
 
 		 282 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  35.14 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  28.8 
 
 		 291 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.62 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.62 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.62 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.17 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.89 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.93 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.31 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  34.46 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  27.38 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  36 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.19 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  30.9 
 
 		 370 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  31.65 
 
 		 421 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  36.02 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  29.36 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  33.07 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.24 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  29.28 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  33.33 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  29.43 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>