More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3556 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  100 
 
 
366 aa  723    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  55.71 
 
 
367 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  60 
 
 
383 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  52.76 
 
 
386 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  44.48 
 
 
365 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  53.57 
 
 
376 aa  332  6e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  48.06 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  48.77 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  40.23 
 
 
376 aa  278  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  47.62 
 
 
282 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  47.58 
 
 
364 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  40.73 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  46.05 
 
 
292 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  46.28 
 
 
361 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  43.69 
 
 
295 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  42.91 
 
 
293 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  41.73 
 
 
301 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  42.75 
 
 
295 aa  196  6e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  33.6 
 
 
458 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.57 
 
 
288 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.7 
 
 
286 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  36.14 
 
 
291 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  39.86 
 
 
308 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  37.5 
 
 
312 aa  145  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.53 
 
 
300 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.09 
 
 
280 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.75 
 
 
288 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2083  hypothetical protein  39.8 
 
 
308 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.22 
 
 
288 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.22 
 
 
288 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.83 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.08 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.46 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  33.33 
 
 
277 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  31.58 
 
 
441 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.82 
 
 
279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  38.65 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.11 
 
 
276 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  33.8 
 
 
441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 
277 aa  135  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0101  hypothetical protein  36.58 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.27 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.86 
 
 
282 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  35.32 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.51 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  35.53 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  34.55 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.51 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.51 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  32.51 
 
 
282 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  35.22 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 
286 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 
286 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 
286 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 
286 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  28.72 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  31.45 
 
 
286 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.16 
 
 
294 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  31.11 
 
 
294 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  30.03 
 
 
285 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.35 
 
 
285 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.09 
 
 
278 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.09 
 
 
278 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  30.04 
 
 
294 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  35.42 
 
 
304 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  30.04 
 
 
294 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.35 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  29.62 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  33.58 
 
 
290 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  30.39 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  31.51 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  29.68 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.35 
 
 
285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  35 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  32.99 
 
 
283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  33.45 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  36.11 
 
 
291 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  29.93 
 
 
291 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  31.97 
 
 
282 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  35.79 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  32.1 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  29.55 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  30.11 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  31.72 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.14 
 
 
278 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.14 
 
 
278 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  34.06 
 
 
289 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  30.15 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  28.52 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  36.4 
 
 
290 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.58 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.07 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  29.15 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.07 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  29.35 
 
 
286 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>