More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2146 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  567  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  49.3 
 
 		 292 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  50.76 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  46.04 
 
 		 295 aa  234  9e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  44.48 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 368 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  46.44 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  43.69 
 
 		 366 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  42.51 
 
 		 386 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  43.45 
 
 		 371 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3067  ABC-3 protein  44.06 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0608457  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  39.3 
 
 		 376 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 370 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0691  ABC-3 protein  46.84 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.0429317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  34.41 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0622  ABC-3 protein  48.12 
 
 		 364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00367536  normal  0.145033 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0225  ABC-3 protein  41.49 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1223  zinc ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  39.02 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03360  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.63 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.402488  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.85 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 458 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.93 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.93 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  36.55 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  36.55 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  34.87 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.45 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.08 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  34.13 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.82 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.82 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.82 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  34.13 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  37.56 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.69 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  37.56 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  30.36 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.58 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.58 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.58 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  36.61 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.58 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.58 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.72 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  35.63 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.9 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  30.5 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  35.22 
 
 		 441 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  33.73 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  34.89 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  31.19 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  33.04 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  28.94 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.03 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.03 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.03 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.03 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  30.03 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  36.23 
 
 		 279 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  30.96 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  36.18 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  32.31 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  29.45 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.26 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.45 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  31.6 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  30.95 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2850  hypothetical protein  33.8 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.833764  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  30.94 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  32.12 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  32.22 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  30.94 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  30.94 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  29.82 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  34.94 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  32.06 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.31 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>