236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2016 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.03 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  33.65 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.94 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30.56 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36.41 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  36.96 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.93 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  36.41 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.87 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.18 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  34.36 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  34.2 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.72 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  32.9 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  32.9 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  32.9 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  29.36 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.8 
 
 		 237 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.44 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.88 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.16 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.64 
 
 		 232 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.96 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  32.02 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  31.72 
 
 		 229 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  40.15 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  36.02 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  39.55 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.13 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.81 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.28 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.64 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  35.23 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 		 231 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.17 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.18 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  31.14 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  38.24 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.89 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.99 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.65 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  31.17 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.47 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  31.8 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.33 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  30.59 
 
 		 219 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.1 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.13 
 
 		 240 aa  91.7  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.06 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.34 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.9 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.86 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.36 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.37 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.37 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.37 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.9 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  27.62 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  30.57 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.29 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.26 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.7 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  29.65 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.77 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  29.91 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.68 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.88 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  33.89 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.72 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.32 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.27 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.9 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  29.28 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  35.82 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.27 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  35.56 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  27.03 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  33.1 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.67 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  28.37 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  29.95 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.58 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.11 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  34.21 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>