269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2347 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  89.11 
 
 
242 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  82.66 
 
 
240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  82.66 
 
 
240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  82.66 
 
 
240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  78.33 
 
 
228 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  64.41 
 
 
240 aa  305  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  63.56 
 
 
230 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.11 
 
 
232 aa  291  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.37 
 
 
238 aa  265  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.12 
 
 
229 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  58.52 
 
 
251 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  52.52 
 
 
224 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.93 
 
 
226 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.74 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  50.64 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  49.37 
 
 
234 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.6 
 
 
240 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  47.21 
 
 
229 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.8 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  46.15 
 
 
227 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  48.47 
 
 
237 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  47.21 
 
 
230 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  42.42 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  45.92 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.36 
 
 
227 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.58 
 
 
235 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  40.69 
 
 
217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.73 
 
 
216 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  37.44 
 
 
220 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  40.1 
 
 
224 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.82 
 
 
220 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  48.3 
 
 
221 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38 
 
 
221 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.39 
 
 
218 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  37.06 
 
 
217 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  41.88 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.73 
 
 
232 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.33 
 
 
222 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.09 
 
 
225 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  41.75 
 
 
239 aa  144  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.71 
 
 
234 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  34 
 
 
235 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.14 
 
 
227 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  39.81 
 
 
226 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  34.85 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.24 
 
 
218 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  34.88 
 
 
229 aa  138  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.97 
 
 
226 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.29 
 
 
236 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.44 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.74 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.36 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  31.79 
 
 
222 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  33.88 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.77 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.18 
 
 
219 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.96 
 
 
227 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.9 
 
 
214 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  33.17 
 
 
215 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  34.2 
 
 
214 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.1 
 
 
161 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  31.28 
 
 
214 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  31.28 
 
 
214 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  35.75 
 
 
236 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  35.75 
 
 
237 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.37 
 
 
247 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.9 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.68 
 
 
237 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  33 
 
 
213 aa  96.3  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.44 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.17 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  35.05 
 
 
232 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  37.78 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  35.08 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  32.99 
 
 
232 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  89  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  31.94 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.22 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.16 
 
 
231 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  30.81 
 
 
227 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.76 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
134 aa  85.9  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.37 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  34.5 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.18 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  36.22 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.5 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  31.72 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  31.72 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  31.72 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  32.61 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  38.35 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  30.26 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.17 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.77 
 
 
134 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>