227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1044 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  100 
 
 		 310 aa  636    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  34.23 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.22 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  99.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.31 
 
 		 235 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  44.03 
 
 		 229 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.61 
 
 		 218 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.75 
 
 		 227 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.46 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  37.65 
 
 		 227 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  38.79 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.03 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 		 233 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.76 
 
 		 226 aa  92.4  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  33.17 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.86 
 
 		 229 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.96 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.42 
 
 		 237 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  33.18 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.41 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.94 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.92 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.78 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.09 
 
 		 224 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.78 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.14 
 
 		 234 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.78 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.78 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.05 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.89 
 
 		 228 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.87 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.68 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.02 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.18 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.52 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  31.72 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  31.72 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  31.72 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.58 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.23 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  30.32 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.71 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.39 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  32.19 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.95 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  30.8 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.68 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.86 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  30.57 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.75 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  30 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.98 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.24 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.25 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.49 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  28.89 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0760  FeoA family protein  50 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000119012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  32.28 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  28.95 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  27.83 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.04 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  29.6 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.92 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.78 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.65 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.08 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.75 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  30.18 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  29.76 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  30 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  34.35 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.07 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  30.95 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  32.54 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  24.19 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1407  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  32.54 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.29 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3773  FeoA family protein  49.3 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.35 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.22 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.09 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>