More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0097 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.22 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.5 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  44.07 
 
 		 139 aa  108  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.31 
 
 		 153 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.14 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.36 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  56.96 
 
 		 84 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  29.33 
 
 		 221 aa  95.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  29.38 
 
 		 160 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  44.83 
 
 		 140 aa  94.4  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 125 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  50.63 
 
 		 80 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.65 
 
 		 142 aa  89  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.83 
 
 		 168 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  26.32 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  50.63 
 
 		 80 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  29.22 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  34.75 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.29 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  50.7 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  47.56 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.07 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  39.13 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  39.29 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  26.13 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  46.48 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  45.71 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.64 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0552  FeoA family protein  48.57 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  38.26 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  38.26 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1127  ferrous iron transport protein A  51.43 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00351255  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  47.22 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  53.52 
 
 		 75 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  36.44 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0972  ferrous iron repressor  51.43 
 
 		 72 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.39 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0317  FeoA family protein  44.74 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  51.43 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  38.79 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  50.7 
 
 		 77 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  53.52 
 
 		 75 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.7 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.77 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  49.3 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  32.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  45.71 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.32 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  47.89 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.83 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  25.96 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  33.58 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.16 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  30.94 
 
 		 142 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  51.43 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  46.58 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  35.09 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.83 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  44.29 
 
 		 78 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  36.84 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  50.7 
 
 		 75 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3543  FeoA family protein  44.3 
 
 		 81 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  26.32 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  26.2 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  47.83 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  47.14 
 
 		 74 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  36.84 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  27.36 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  45.83 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  37.27 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1016  FeoA family protein  45.21 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.83545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  41.43 
 
 		 848 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  27.39 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  29.41 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  33.9 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  43.66 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  31.65 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  47.76 
 
 		 784 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  26.76 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  35.96 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  32.08 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  43.48 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2670  ferrous iron transport protein A, putative  42.86 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.501663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0318  FeoA family protein  54.1 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  26.09 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  39.62 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  39.62 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  31.62 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>