205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1294 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 142 aa  291  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  48.89 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  48.41 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.15 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  43.94 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  40.65 
 
 		 238 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.2 
 
 		 231 aa  87.8  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  43.59 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  39.32 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  37.3 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.16 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  44.26 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.17 
 
 		 239 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.98 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.78 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  41.23 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.83 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  40.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.05 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.62 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  34.92 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.19 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.44 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  38.17 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  36.07 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.31 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  36.13 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  34.75 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  38.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  35.04 
 
 		 210 aa  67  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.35 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  35.54 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  32.58 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.07 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  35.9 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.61 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  35.45 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.95 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.09 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 237 aa  62  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  35.24 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.19 
 
 		 228 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  29.92 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  33.64 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.85 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  38.71 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  30.33 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  38.33 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  37.04 
 
 		 250 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  35.25 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.33 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.84 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  37.04 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  36.19 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  36.67 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  37.39 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  29.31 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.15 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.59 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  33.06 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.88 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.73 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.73 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.73 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  34.45 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.82 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.83 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 229 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>