223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2328 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  67.39 
 
 
142 aa  200  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  57.85 
 
 
156 aa  149  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  57.26 
 
 
134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  45.76 
 
 
148 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  39.85 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  41.73 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.69 
 
 
154 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  40.16 
 
 
163 aa  105  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  45.38 
 
 
138 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  38.03 
 
 
143 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  39.86 
 
 
145 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  35.82 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  39.55 
 
 
160 aa  97.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  45.19 
 
 
390 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  62.69 
 
 
72 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  37.31 
 
 
142 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  37.31 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  35.94 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.09 
 
 
231 aa  90.5  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  37.31 
 
 
142 aa  90.5  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  32.58 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  39.13 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.15 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.93 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  41.07 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.25 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
166 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  40.52 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  40.91 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  40.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  39.17 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  40.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.15 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.54 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  35.04 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  40.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  40.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  40.71 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  41.44 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  38.18 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.29 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  39.29 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  40.52 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  39.13 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  41.88 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  38.74 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  33.83 
 
 
147 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  38.74 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  39.09 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  41.07 
 
 
238 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  37.84 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  34.59 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  36.8 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.48 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  30.66 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  29.6 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.96 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  37.61 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  39.42 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  36.04 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  32.8 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  34.86 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  34.86 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  32.43 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.44 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  32.43 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.44 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  34.09 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.44 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  36.94 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.59 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  31.34 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  31.34 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.26 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>