199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0620 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  62.39 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.32 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  48.36 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.07 
 
 		 231 aa  87.4  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.4 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  41.59 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  38.26 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  38.05 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  35.4 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.21 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  36.7 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  38.76 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.25 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.29 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  35.71 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 		 176 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  33.03 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  30.91 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.4 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  32.73 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  32.14 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  32.14 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  32.43 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  32.08 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  30.09 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  40.95 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  32.5 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  33 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  35.19 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  35.14 
 
 		 210 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  34.29 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  34.43 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  28.83 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  31.15 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.96 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  31 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  31 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  31 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  31 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.43 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.91 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  28.57 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  30.77 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  29.2 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.66 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  33.94 
 
 		 221 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.24 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  29.63 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  30.56 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  31.07 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.38 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.04 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  31.62 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  29.09 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.96 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  29.31 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  29.91 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.23 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  28.45 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  30.51 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  36.45 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  33.04 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  35.16 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>