213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0573 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  65.57 
 
 
134 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  61.67 
 
 
144 aa  153  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.15 
 
 
142 aa  106  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  47.93 
 
 
139 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.32 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.87 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.66 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  41.38 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  38.46 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.37 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.33 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 
231 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  40.52 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  39.66 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  37.9 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  36.97 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  35.2 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  33.61 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  37.82 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  39.29 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.88 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.88 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  39.32 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  35.14 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.88 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 
237 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.09 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  39.45 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.01 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  42.61 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  35.51 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.51 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.33 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  34.43 
 
 
270 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.74 
 
 
221 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  38.79 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  35.96 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.83 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  36.84 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 
236 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  31.67 
 
 
226 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.03 
 
 
228 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  37.93 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  34.45 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.73 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.43 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  40.18 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  33.88 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  39.09 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  37.17 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.97 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.23 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.86 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.48 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.69 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  33.91 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  33.91 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  33.88 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  35.78 
 
 
227 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  30.1 
 
 
230 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.09 
 
 
242 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.4 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  32.23 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.19 
 
 
225 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  33.91 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  36.52 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  36.52 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.14 
 
 
218 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  34.17 
 
 
239 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.79 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  34.45 
 
 
156 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.17 
 
 
218 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  30.56 
 
 
251 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  36.97 
 
 
144 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.07 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.07 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.07 
 
 
240 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  31.67 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 
207 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  29.2 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  35.09 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  31.97 
 
 
224 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  33.9 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  33.63 
 
 
223 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>