242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0525 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 
140 aa  285  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.41 
 
 
231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.38 
 
 
207 aa  103  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  37.5 
 
 
160 aa  98.2  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 
225 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  42.74 
 
 
163 aa  97.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.68 
 
 
168 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  44.07 
 
 
238 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  44.54 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  37.6 
 
 
223 aa  90.1  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.33 
 
 
176 aa  90.1  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  39.17 
 
 
177 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 
130 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.98 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  40.5 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  44.14 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  35.65 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.38 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  39.17 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.17 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  39.47 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  38.28 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  37.17 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  41.03 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.35 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  39.17 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  40.17 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  38.33 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  40.98 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  35 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.7 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.09 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  34.48 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.7 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.62 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.96 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  38.46 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  38.46 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  35.54 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  35.48 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  40.17 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  35.48 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  35.48 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  35.48 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  36.44 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  33.85 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  36.22 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  36.15 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  33.62 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  36.13 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  36.29 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.19 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  33.06 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.33 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  30.77 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.66 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.7 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  33.61 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  36.07 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  31.82 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  35.9 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.48 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.91 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.11 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  35.34 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  35.9 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  32 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  32.76 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  36.61 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>