215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1535 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  46.15 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  47.71 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.08 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  45.51 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.51 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  45.16 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  41.35 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  45.86 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  48.76 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  47.93 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  44.36 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  39.39 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  38.64 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  35.77 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.52 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  35.38 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  37.4 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  33.82 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  37.5 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  36.59 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  37.21 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.34 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  39.82 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.9 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  32.26 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  39.05 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.87 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  38.1 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  38.1 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  38.1 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.09 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.51 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  30.33 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.34 
 
 		 237 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  38.14 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  28.78 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  37.59 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  31.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  31.67 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  34.29 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  31.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  31.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.61 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  31.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  31.19 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  34.91 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.78 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  33.06 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  30.97 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.24 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  32.5 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  32.5 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  33.96 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  32.38 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  34.91 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  35.24 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.97 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  28.69 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.4 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  28.68 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  40 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  34.91 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.46 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  36.28 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  37.21 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.51 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.61 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.93 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  32.08 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.92 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  42.62 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  31.68 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  27.03 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>