237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0246 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  49.21 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  41.38 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.66 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  40.71 
 
 		 225 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.38 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.18 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  41.23 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  37.01 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.88 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  39.32 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.93 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  40.54 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  42.11 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  41.07 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  43.12 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.89 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  42.57 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  37.07 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  41.23 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.94 
 
 		 239 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  34.48 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  38.6 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.32 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  35.45 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.6 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  37.19 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  38.53 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  34.21 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  37.19 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  35.65 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  37.74 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  34.71 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  39.45 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  41.82 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  35.09 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  36.84 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.83 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.93 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.91 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  34.96 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  33.87 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  34.78 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  33.63 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  30.09 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.91 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.96 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.93 
 
 		 239 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.51 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.58 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  38.1 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.19 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.5 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.78 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  33.63 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  31.82 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  36.11 
 
 		 218 aa  60.1  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  33.62 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  36.21 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.82 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  32.2 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.86 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  38.24 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  36.9 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  33.62 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  34.65 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  32.48 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  38.53 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>