214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0973 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  100 
 
 
148 aa  299  7.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  44.44 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.76 
 
 
160 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  47.1 
 
 
156 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  36.76 
 
 
163 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  38.97 
 
 
160 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  43.22 
 
 
145 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  36.15 
 
 
154 aa  103  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  43.97 
 
 
134 aa  102  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  41.59 
 
 
160 aa  102  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  38.64 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  38.52 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  36.76 
 
 
159 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  41.38 
 
 
142 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  39.34 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  40.52 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  39.2 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  39.66 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.35 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  38.1 
 
 
142 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  39.42 
 
 
390 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.53 
 
 
121 aa  87.4  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  35.71 
 
 
141 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  35 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  33.85 
 
 
157 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  36.44 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.17 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  33.58 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.35 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.5 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.64 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.81 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  38.39 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.3 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  47.76 
 
 
72 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.57 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  36.13 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.9 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  39.62 
 
 
221 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  36.11 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  36.11 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  35.04 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.52 
 
 
221 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.94 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  36.54 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  34.82 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  42.67 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  31.62 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  38 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.33 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.33 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  31.5 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  39.47 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  34.71 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  34.82 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.77 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  31.09 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  34.62 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  32.5 
 
 
226 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.32 
 
 
232 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  41.67 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  31.75 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  31.86 
 
 
238 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  36.07 
 
 
229 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  31.93 
 
 
164 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>