169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1477 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  100 
 
 
143 aa  296  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  60 
 
 
163 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  60.53 
 
 
160 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  48 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  47.3 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  44.44 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  42.67 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  50.77 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  49.28 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  43.06 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  49.23 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  47.22 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  43.66 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.58 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.83 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.19 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  45.59 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  46.15 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  44.62 
 
 
225 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  40.85 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  41.25 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  37.68 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  42.25 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  38.57 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.94 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  44.12 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.79 
 
 
125 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  36.05 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  50 
 
 
390 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  41.54 
 
 
227 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.67 
 
 
239 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  44.12 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  32.35 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  40.91 
 
 
214 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  40.91 
 
 
214 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  38.46 
 
 
159 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  39.53 
 
 
219 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  39.06 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.04 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.44 
 
 
240 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  37.68 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  29.27 
 
 
226 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  38.24 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  41.54 
 
 
229 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  36.11 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  44.19 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.25 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.25 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.25 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  29.57 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  29.57 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  29.57 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  28.71 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  29.57 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  29.57 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.51 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.94 
 
 
225 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0133  iron dependent repressor  37.68 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  30.1 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  41.86 
 
 
214 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  36.11 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  36.11 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.39 
 
 
227 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  30 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.19 
 
 
232 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  37.21 
 
 
239 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.94 
 
 
221 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.36 
 
 
236 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.36 
 
 
227 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.91 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.82 
 
 
227 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.86 
 
 
214 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.86 
 
 
214 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 
164 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  40.58 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.68 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  40.54 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  33.33 
 
 
214 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.71 
 
 
232 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.88 
 
 
237 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  41.86 
 
 
214 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  36.62 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>