230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1620 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 176 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.8 
 
 		 168 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  54.37 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  44.65 
 
 		 225 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.53 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.86 
 
 		 231 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.04 
 
 		 239 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.69 
 
 		 142 aa  95.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  35.22 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 133 aa  92  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  41.09 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36.8 
 
 		 148 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  38.98 
 
 		 140 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.71 
 
 		 125 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.43 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.43 
 
 		 134 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.43 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.25 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.1 
 
 		 144 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  39.67 
 
 		 152 aa  84.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  34.01 
 
 		 143 aa  84  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  33.82 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  38.14 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.59 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  38.05 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.33 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  35.65 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  34.56 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  36.36 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  31.69 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  37.17 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  37.17 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  33.81 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  36.67 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  33.06 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  30.71 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  40.87 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  37.61 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.19 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  37.07 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  36.28 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.45 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  35.04 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  36.75 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  33.06 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  31.71 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  35.29 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  30.16 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.65 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  33.88 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  35.71 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  37.14 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.45 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.21 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  34.71 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  30.07 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  37.14 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.88 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  30.71 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.58 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.36 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  34.17 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  36.21 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  36.21 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  27.61 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  33.62 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.79 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33.93 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.85 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  35.96 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.26 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>