193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2411 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  100 
 
 		 156 aa  323  8.000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  61.67 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  62.93 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.85 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  47.1 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  46.96 
 
 		 390 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  47.01 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  42.86 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  38.71 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  37.21 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  40.5 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.93 
 
 		 121 aa  93.6  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  39.68 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  38.24 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  32.06 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  36.76 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  36.75 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  65.15 
 
 		 72 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  37.3 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  36.59 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.5 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  36.84 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  36.84 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  40 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  32.52 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  36.28 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  35.24 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  35.24 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  35.24 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  35.24 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  35.24 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  36.13 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  32.82 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  38.74 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  37.61 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  38.1 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  33.94 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  36.61 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  34.86 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  36.19 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  29.29 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  37.29 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.09 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  36.7 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  29.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  37.14 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.85 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1477  iron dependent repressor  44.44 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000154741  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  36.84 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  34.96 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  37.38 
 
 		 123 aa  67  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.54 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.21 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.94 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.15 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  25.38 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  36 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  34.82 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  31.48 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  31.48 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  30.56 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.65 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.48 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.09 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  34.62 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.25 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.25 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  29.01 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.25 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.25 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  33.04 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>