More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0541 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 
231 aa  148  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  34.5 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  48.03 
 
 
160 aa  122  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  34.1 
 
 
223 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  46.55 
 
 
140 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29 
 
 
239 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.28 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  36.89 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  36.5 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  38.35 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  39.66 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.9 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  35.66 
 
 
130 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
172 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  32.89 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  36.72 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0972  FeoA family protein  51.43 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000216007  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1786  FeoA family protein  53.42 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0221139  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.66 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  50.7 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  52.11 
 
 
80 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  33.62 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3411  FeoA family protein  53.52 
 
 
77 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  54.05 
 
 
77 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.07 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.4 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  51.35 
 
 
77 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  53.52 
 
 
73 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  28.64 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  38.02 
 
 
159 aa  72  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.13 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  46.67 
 
 
75 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  36.5 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0622  FeoA family protein  47.3 
 
 
75 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.927847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.67 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0570  FeoA family protein  48.57 
 
 
78 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157552  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1138  FeoA family protein  53.52 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000908458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0745  FeoA family protein  65.31 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2566  FeoA family protein  47.44 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  37.61 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  51.35 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0433  FeoA family protein  44.59 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  44.93 
 
 
784 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0619  hypothetical protein  47.22 
 
 
73 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000301048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  36.75 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.08 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20060  Fe2+ transport system protein A  45.83 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.200768  normal  0.638087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  34.38 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  48.65 
 
 
77 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1930  ferrous iron transport protein A  43.66 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2697  FeoA family protein  40.79 
 
 
76 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0855124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0777  hypothetical protein  47.89 
 
 
82 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.658901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  25.35 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2724  FeoA family protein  47.89 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000395552  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3854  Fe2+ transport system protein B-like protein  44.87 
 
 
117 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746971 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.5 
 
 
148 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1819  ferrous iron transport protein A  45.33 
 
 
79 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2469  hypothetical protein  43.84 
 
 
81 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1193  FeoA family protein  45.07 
 
 
73 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1435  hypothetical protein  49.3 
 
 
84 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000347504  normal  0.0226993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 
158 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0792  FeoA family protein  52.05 
 
 
76 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0466  FeoA family protein  45.33 
 
 
79 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0753  FeoA family protein  41.89 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000372394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  32.33 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  48.65 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  28.5 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0285  Fe2+ transport system protein A  38.36 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.621067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.71 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1089  FeoA family protein  45.07 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000327089  hitchhiker  0.0000000000000328537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.35 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3659  FeoA family protein  52.78 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  35.59 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0194  Fe2+ transport system protein A  41.11 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000592794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0107  FeoA family protein  45.07 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3766  FeoA family protein  52.78 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  34.17 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0168  hypothetical protein  45.21 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.39 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0972  FeoA family protein  50.82 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0271378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1656  FeoA family protein  45.83 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  hitchhiker  0.000120569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1912  putative ferrous iron transport protein  36.49 
 
 
81 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00246631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2075  ferrous iron transport protein A  41.89 
 
 
97 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.874306 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  49.28 
 
 
106 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0872  FeoA family protein  47.22 
 
 
79 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1630  feoA protein  36.49 
 
 
83 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  35.4 
 
 
145 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>