228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00918 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
155 aa  307  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  73.86 
 
 
164 aa  234  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  73.2 
 
 
164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  75.68 
 
 
156 aa  223  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  71.52 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  76.43 
 
 
166 aa  208  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  76.43 
 
 
166 aa  208  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  72.79 
 
 
171 aa  206  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  70.42 
 
 
153 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  64.54 
 
 
157 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  64.54 
 
 
157 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  64.54 
 
 
157 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  64.54 
 
 
157 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  72.93 
 
 
163 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  64.29 
 
 
157 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  66.67 
 
 
153 aa  187  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  63.12 
 
 
157 aa  179  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  62.86 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  66.92 
 
 
163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  61.76 
 
 
152 aa  168  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  59.86 
 
 
170 aa  168  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  55.81 
 
 
152 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  55.81 
 
 
152 aa  137  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  47.4 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  51.56 
 
 
149 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  51.08 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  53.23 
 
 
141 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  54.4 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  45.95 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.34 
 
 
154 aa  94  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  39.13 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  41.07 
 
 
143 aa  90.5  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  35.61 
 
 
160 aa  90.1  9e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  41.58 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  39.05 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  39.6 
 
 
142 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  32.76 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  40.59 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  36.89 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.74 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.34 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  32.14 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  36.75 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35.09 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  36.19 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  37.07 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.38 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  34.23 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  36.84 
 
 
238 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.9 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  34.48 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.28 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  35.34 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  35.34 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  34.82 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  34.58 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.96 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.65 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.21 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.91 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.34 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.86 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  32.09 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  33.33 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.4 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  35.59 
 
 
227 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  28.95 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  31.07 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  32.08 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  33.33 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 
218 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.86 
 
 
237 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.24 
 
 
234 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.09 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  30.84 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 
225 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  31.13 
 
 
390 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  41.94 
 
 
250 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>