199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0875 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  99.36 
 
 
157 aa  316  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  90.97 
 
 
155 aa  288  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  90.32 
 
 
155 aa  285  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  84.71 
 
 
157 aa  268  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  66.67 
 
 
153 aa  197  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  70.71 
 
 
153 aa  197  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  69.01 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  66.43 
 
 
156 aa  192  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  63.87 
 
 
166 aa  189  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  63.87 
 
 
166 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  64.54 
 
 
155 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  69.4 
 
 
171 aa  186  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
153 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  60.54 
 
 
164 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  57.86 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  61.87 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  65.41 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  57.78 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  48.94 
 
 
156 aa  140  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  52.38 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  52.38 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  48.44 
 
 
149 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  46.97 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  48.78 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  44.85 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.03 
 
 
160 aa  94.7  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  32.28 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  39.83 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
154 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  41.51 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.71 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  39.25 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.91 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  35.54 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  35.24 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.19 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  36.67 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.39 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  36.79 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  34.26 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  37.1 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.47 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  33.62 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  32.76 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  37.9 
 
 
237 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  31.19 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  33.63 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.95 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  33.04 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.4 
 
 
239 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  36.56 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.64 
 
 
134 aa  67  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  36.84 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  35.71 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  31 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.82 
 
 
221 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  36.28 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  36.28 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  32.14 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.76 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.13 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  32.74 
 
 
144 aa  61.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  39.05 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.29 
 
 
227 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  29.2 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  37.04 
 
 
227 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>