200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0797 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  100 
 
 		 159 aa  323  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  58.94 
 
 		 159 aa  190  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  45.51 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.66 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.95 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  45.03 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  40.6 
 
 		 144 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  37.88 
 
 		 137 aa  97.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.12 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  38.97 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  36.76 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  35.04 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  38.71 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.58 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  35.56 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  36.64 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  34.46 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  35.66 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  35.11 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.59 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  34.09 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  35.34 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  35.34 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  35.96 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  35.96 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  37.04 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  35.4 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.29 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  33.61 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.53 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  36.21 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  30.4 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  37.19 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  35.14 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.95 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  35.71 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  35.71 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.37 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.67 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.2 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  35.83 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.43 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.71 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.26 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.55 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  25.38 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  31.53 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  33.63 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.2 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.58 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36.67 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.71 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  30.7 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.32 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  28.79 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  27.82 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  30.51 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  34.29 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.96 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  34.92 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  27.21 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  31.37 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.85 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  29.6 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.82 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.82 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  32.18 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  29.2 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  30.51 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  29.2 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  29.2 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>