260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1581 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 125 aa  255  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  40.68 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.29 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  37.5 
 
 		 238 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.65 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.71 
 
 		 176 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  37.07 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  36.75 
 
 		 177 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  35.04 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  35.94 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 231 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.17 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  33.94 
 
 		 229 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  36.84 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  36.61 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.68 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  33.63 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  34.78 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  33.9 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  37.17 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  35.2 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  33.04 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.48 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  31.58 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  34.82 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.82 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  34.4 
 
 		 241 aa  73.6  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  36.61 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  31.03 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  33.06 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  36.04 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  36.61 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  32.2 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  34.43 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.21 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.13 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  34.51 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  32.76 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  38.05 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  32.76 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.5 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  37.61 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  34.17 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  34.91 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  32.23 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  35.45 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.85 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.14 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  34.75 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  29.75 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  31.25 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  31.3 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.51 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.4 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.85 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.86 
 
 		 225 aa  67  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.35 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  31.97 
 
 		 230 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  31.36 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  30.51 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.51 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  32 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.46 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.19 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.19 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  34.15 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  33.63 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  30.58 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>