192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3776 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  53.33 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  52.27 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  41.35 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.64 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  39.39 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  39.02 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.44 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  37.88 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  36.09 
 
 		 159 aa  95.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  38.64 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.02 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  39.23 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  36.92 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  37.4 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  35.94 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  36.59 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.56 
 
 		 176 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  36.59 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  32.56 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  37.3 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  34.48 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  35.77 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  36.29 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.15 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  35.77 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  30.17 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 172 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  40.87 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  35.09 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.95 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  33.33 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  31.4 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  35.71 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  30.15 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  37.4 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.18 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.59 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  30.97 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  36.28 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  29.13 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  43.08 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  29.46 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  31.25 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.4 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  33.03 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.2 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  30.84 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.64 
 
 		 240 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.97 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  31.58 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  27.69 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  34.88 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.56 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.51 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  29.79 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.57 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.28 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  28.33 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  30.16 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.34 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.59 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.58 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.41 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  32.11 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.34 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.09 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  30.28 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>