205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12870 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  273  8e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.57 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  57.03 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.94 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  42.75 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.02 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  37.7 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  35.83 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  35.83 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.84 
 
 		 231 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  35.83 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  38.76 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  36.84 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.34 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.23 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.74 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.89 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  39.34 
 
 		 250 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  39.82 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  39.82 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.41 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  34.92 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.88 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.22 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.3 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  34.17 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  30.89 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.89 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  39.82 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  38.14 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  39.83 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  29.51 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  37.4 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.53 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  36.79 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  33.07 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  37.21 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  31.93 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  30.33 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  35.54 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  34.17 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  32.54 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  34.92 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  35.14 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.82 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  32.46 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.32 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  34.88 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  32.81 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  32.81 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  32.81 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.51 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  33.06 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.38 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  30.56 
 
 		 230 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.25 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.86 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  36.21 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  33.59 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.98 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.65 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  33.63 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  34.48 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  28.24 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  33.64 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.09 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.75 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  31.3 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  29.31 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  33.93 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  32.77 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 		 240 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  32.33 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  31.36 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.91 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  38.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  31.67 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  28.72 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  31.86 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.04 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.14 
 
 		 233 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  28.93 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>