257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0438 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  100 
 
 		 138 aa  268  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1198  iron dependent repressor  59.65 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  42.61 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  39.1 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.37 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  30.94 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  37.4 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  38.79 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  39.47 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  37.07 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  31.43 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.65 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  36.21 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  35.65 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  35.34 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  32.46 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  36.84 
 
 		 236 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  37.72 
 
 		 237 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  41.84 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.71 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  39.45 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  32.11 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  34.96 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  34.19 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.47 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0335  iron dependent repressor  65.57 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.127848  decreased coverage  0.00440763 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  26.5 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.07 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  32.17 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.52 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.86 
 
 		 224 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.52 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  34.21 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  36.04 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.48 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  33.64 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  31.93 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.48 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  31.67 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  26.02 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 218 aa  60.1  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.65 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  26.02 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.62 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.57 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  27.42 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  26.02 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.64 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  30.95 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.39 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.94 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  37.76 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  32.23 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.52 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  29.57 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  30.7 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  32.99 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  30.97 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 237 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  32.76 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.75 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  33.9 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  34.17 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  31.86 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.23 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  33.61 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.55 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.72 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  32.14 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  30.7 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  31.9 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.52 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.96 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  32.11 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  27.73 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  32.5 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  31.43 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.17 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  31.9 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  32.5 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>