170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1752 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  100 
 
 
196 aa  393  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  30.57 
 
 
213 aa  89  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.79 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.79 
 
 
237 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.44 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.44 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.44 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.54 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.88 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  32.93 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  30.86 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  39.09 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  31.02 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.16 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  33.05 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.14 
 
 
233 aa  71.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.72 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.61 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.61 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.45 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  28.87 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  27.98 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  27.04 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  31.98 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.52 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.5 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  40.38 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.45 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.9 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  27.32 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.21 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.12 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  27.94 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.32 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.19 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  27.04 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.91 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  31.58 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  28.75 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  28.87 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.5 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.58 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.85 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  26.4 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.09 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.51 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.95 
 
 
237 aa  61.6  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  35.96 
 
 
220 aa  61.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  25.77 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  34.31 
 
 
441 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.36 
 
 
218 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  37 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.98 
 
 
234 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  42.86 
 
 
134 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 
235 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  35.85 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.73 
 
 
225 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.48 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.38 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.87 
 
 
216 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  27.94 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  36.36 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  35.09 
 
 
217 aa  58.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.26 
 
 
135 aa  57.8  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.38 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  28.68 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  27.37 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.48 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  32.08 
 
 
441 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.64 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.38 
 
 
134 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
230 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  40 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.38 
 
 
231 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  29.31 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 
233 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.19 
 
 
148 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.02 
 
 
229 aa  54.7  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.43 
 
 
229 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.04 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.37 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.82 
 
 
237 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.88 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.16 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  29.71 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  34.38 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  29.71 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  30.48 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 
228 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.72 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  25 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  34.26 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  32.38 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  26.84 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>