164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0126 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 135 aa  273  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.84 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 232 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  36.26 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.35 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.75 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.59 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.06 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.27 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  33.59 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  33.85 
 
 		 236 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 248 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  32.82 
 
 		 228 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  29.71 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.06 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.85 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.06 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  37.36 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  34 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.26 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 247 aa  62  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  33.85 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.4 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  40.43 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.45 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.6 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.06 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.06 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  31.53 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.91 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.03 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.15 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  31.78 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1784  iron dependent repressor  30.53 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  34.26 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.8 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.84 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  29.01 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.23 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.91 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  31 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.71 
 
 		 216 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.3 
 
 		 225 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.3 
 
 		 225 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  30.77 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.84 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  29.03 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.78 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  29.91 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  33.33 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  30.23 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  25.2 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2442  Iron dependent repressor:FeoA  32.95 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.681497  normal  0.911971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  31.45 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.67 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.99 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31.01 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  29.01 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  29.84 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  29.84 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  29.84 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  28.89 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.08 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.91 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.28 
 
 		 239 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  29.85 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  29.03 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.4 
 
 		 223 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.91 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  29.21 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  32.8 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.48 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  29.03 
 
 		 229 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  30.53 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 234 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.32 
 
 		 239 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.22 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.55 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.48 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  50.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.46 
 
 		 229 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  29.03 
 
 		 244 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>