194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2071 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  100 
 
 
145 aa  300  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  66.41 
 
 
155 aa  197  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.22 
 
 
160 aa  170  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  54.35 
 
 
141 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  49.25 
 
 
147 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  39.55 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.02 
 
 
227 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.61 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 
240 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.77 
 
 
218 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  33.02 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.2 
 
 
221 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.01 
 
 
227 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.89 
 
 
224 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
239 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  28.81 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  29.63 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.46 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  33.02 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.48 
 
 
240 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.97 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  28.45 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.75 
 
 
236 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  30.91 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  29.57 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  34.51 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  26.72 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  26.72 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  30.19 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  36.14 
 
 
224 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.79 
 
 
240 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  30 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  30 
 
 
166 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.69 
 
 
235 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 
226 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  29.73 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.91 
 
 
251 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  29.91 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  29.06 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  31.13 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.43 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  29.73 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  29.82 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  30.19 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.01 
 
 
239 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.08 
 
 
234 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  28.07 
 
 
226 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  30.89 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  29.91 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  27.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  27.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  27.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  27.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  27.93 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.08 
 
 
248 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.04 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.75 
 
 
225 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  30.43 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.04 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  28.81 
 
 
218 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  35.63 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  28.95 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  26.83 
 
 
234 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.21 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  27.1 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 
155 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  29.27 
 
 
242 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  28.09 
 
 
144 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.1 
 
 
226 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.17 
 
 
226 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  33.82 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.69 
 
 
217 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 
223 aa  50.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 
232 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.91 
 
 
222 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  36.25 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  25.93 
 
 
170 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.51 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  28.46 
 
 
240 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>