190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0992 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  66.41 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.25 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1170  iron dependent repressor  55.47 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0817  iron dependent repressor  49.63 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.159865  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2089  iron dependent repressor  42.22 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  37.7 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  32.09 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.46 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  35.25 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.45 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.47 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.15 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.3 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.78 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  32.56 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 236 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  33.91 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.45 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.43 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.79 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  32.43 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.15 
 
 		 239 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.62 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.4 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.48 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  30.84 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.79 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.66 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.53 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.96 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  30.7 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  29.71 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  29.71 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  29.71 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  29.73 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  28.29 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  29.82 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.7 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  31.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  30.71 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.98 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.63 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  34.34 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  32.46 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.45 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  38.96 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  38.96 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  33.88 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  29.51 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  26.97 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  28.89 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  29.36 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  27.93 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  27.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  33.65 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  35.92 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.7 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  32.65 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  28.18 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  32.32 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  28.45 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  27.1 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  28.28 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.68 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  32.74 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  25.41 
 
 		 237 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  28.93 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>