170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2065 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0089  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.71 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0581  iron dependent repressor  34.11 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000800719  hitchhiker  0.0013291 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0126  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.97 
 
 		 213 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1752  iron dependent repressor  33.05 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.43 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  37.39 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.29 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  37.27 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.77 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  37.27 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.26 
 
 		 233 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  37.27 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  29.84 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  32.26 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.65 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  29.84 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  29.41 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.52 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.89 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.3 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  29.84 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  31.71 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.43 
 
 		 248 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  30.4 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.48 
 
 		 242 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  28.46 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  34.59 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  29.01 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.03 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.71 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  30.48 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.09 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.95 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.24 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.46 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  28.68 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  29.84 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  30.3 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  29.52 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  29.52 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  29.52 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.58 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.15 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.67 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  28.24 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.24 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  42.39 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.01 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.72 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  29.84 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.48 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.73 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  28.23 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.73 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  29.6 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.72 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.85 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  28 
 
 		 441 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.61 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.19 
 
 		 229 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.95 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  25.95 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  29.81 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0992  iron dependent repressor  28.93 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0545444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  25.95 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.2 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  25.95 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  32.69 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  25.95 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.4 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  27.42 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.61 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  27.12 
 
 		 230 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1636  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.62 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  31 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.22 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  27.21 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  33.94 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  26.61 
 
 		 230 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>