205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0466 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  37.07 
 
 
210 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  33.19 
 
 
232 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  31.13 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.25 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.63 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.91 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.14 
 
 
176 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.75 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.75 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.75 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  29.53 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.74 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  27.22 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  33.91 
 
 
138 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.75 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.75 
 
 
134 aa  63.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  25.94 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.03 
 
 
224 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.81 
 
 
125 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  27.5 
 
 
148 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  33.68 
 
 
140 aa  61.6  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.75 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.6 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.51 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  24.07 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.78 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.94 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  31.36 
 
 
134 aa  58.9  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.92 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  27.68 
 
 
270 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2065  iron dependent repressor  30.3 
 
 
130 aa  58.2  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.39 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30 
 
 
142 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  27.5 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.42 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  29.75 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  31.2 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.75 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.75 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.89 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.26 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  30.43 
 
 
246 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30.4 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30.4 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30.4 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.43 
 
 
254 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  24.89 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.77 
 
 
240 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.36 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.26 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.43 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  30.17 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  33.33 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.71 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.33 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.48 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.76 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.31 
 
 
163 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  36.9 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  24.14 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.3 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.48 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  29.89 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  28.66 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1568  FeoA family protein  40 
 
 
79 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.21 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  31.91 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  27.43 
 
 
144 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  28.37 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.81 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 
127 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  27.13 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  23.59 
 
 
235 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  25 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.72 
 
 
153 aa  52.4  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.67 
 
 
121 aa  52  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  31.07 
 
 
137 aa  52  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.46 
 
 
230 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.63 
 
 
232 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  30.3 
 
 
154 aa  52  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 
237 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  25.28 
 
 
217 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  27.67 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  30.21 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  27.56 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.45 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 
133 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  23.71 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  26.67 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.18 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  29.89 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  32.5 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>