201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12960 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  284  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.35 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  48.36 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  40.71 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  34.48 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  38.68 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  36.52 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.52 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.17 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.27 
 
 		 231 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  34.19 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  34.19 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.8 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  31.4 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  32.79 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  30.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  32.74 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  34.21 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.95 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.09 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  34.26 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  32.77 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  32.17 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  36.28 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  35.09 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  34.71 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.96 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  32.43 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  34.78 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.33 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.63 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  33.02 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  28.95 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  31.93 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  33.33 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  34.91 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  29.91 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.77 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  29.55 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  31.03 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  29.81 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.29 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  28.44 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  26.89 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  27.52 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  29.82 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  30.25 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  27.93 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  32.35 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  29.17 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.91 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  30.7 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.91 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.37 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  29.63 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.25 
 
 		 254 aa  57  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.73 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  30.36 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  30.39 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  29.2 
 
 		 255 aa  57  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  28.32 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  28.68 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  28.69 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>