169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0384 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.18 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  40.79 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  33.19 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  31.94 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.79 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  41.44 
 
 		 140 aa  78.2  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  36.97 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  27.39 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.85 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.67 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.17 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.25 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  30.97 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  26.81 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.34 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.33 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.21 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.09 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  26.2 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.7 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.5 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  29.58 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  24.56 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.07 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  27.89 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  36.61 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  28.95 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.83 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  28.95 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  29.19 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  28.95 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.81 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  27.93 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.8 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.88 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.83 
 
 		 125 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.36 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 148 aa  52.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.19 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  31.15 
 
 		 130 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  29.35 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  41.79 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  29.12 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.86 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.16 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  33.59 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  40.62 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.68 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.47 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  25.24 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.18 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  24.61 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.41 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.95 
 
 		 126 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  27.96 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  24.27 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.3 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30.43 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30.43 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30.43 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  41.27 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 133 aa  48.5  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  33.68 
 
 		 466 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.52 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  32.74 
 
 		 127 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  42.62 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.7 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2071  iron dependent repressor  29.52 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.588423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  29.66 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  32.18 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  36.99 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.56 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  30.17 
 
 		 121 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  30.83 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.9 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  27.83 
 
 		 310 aa  46.6  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  29.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  32.1 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  28.73 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  32.94 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  34.25 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  27.2 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  29.17 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  35.56 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.44 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 127 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  31.36 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  27.82 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  34.57 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.09 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  28.26 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>