214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0572 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.22 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.1 
 
 
207 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.19 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  40.95 
 
 
140 aa  88.6  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  38.1 
 
 
160 aa  86.3  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  33.78 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.06 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  36.29 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.16 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.08 
 
 
232 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  27.36 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  32.61 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  40.95 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.75 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  24.11 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.67 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  27.96 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.3 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.32 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.58 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  35.71 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  32.26 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  31.15 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.77 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.22 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  32.26 
 
 
163 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  33.06 
 
 
142 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0156  iron dependent repressor  35 
 
 
167 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.179835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  30.16 
 
 
160 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  23.87 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 
141 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.08 
 
 
139 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  27.37 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  25.26 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  24.07 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.98 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  28.11 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  31.75 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.21 
 
 
172 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  34.29 
 
 
160 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.63 
 
 
126 aa  59.3  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.19 
 
 
229 aa  58.9  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  36.21 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.69 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  27.78 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  35.65 
 
 
156 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  28.57 
 
 
142 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  28.97 
 
 
135 aa  58.2  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  31.43 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.23 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  29.03 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.91 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0146  iron dependent repressor  32 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  35.58 
 
 
121 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  29.27 
 
 
150 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.45 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  22.03 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  29.79 
 
 
148 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  25.33 
 
 
134 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  31.78 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
123 aa  56.6  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  25.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  25.12 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  26.24 
 
 
140 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  30.65 
 
 
142 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  32.52 
 
 
149 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  23.72 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  29.6 
 
 
138 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.37 
 
 
143 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  23.72 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.76 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 
143 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  32.26 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  32.26 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  28.8 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  31.62 
 
 
141 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  24.67 
 
 
134 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  35.35 
 
 
155 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  24 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  24 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>